工作動態(tài)
我中心科研人員提出了機器學(xué)習輔助的負載均衡計算方案,并推廣應(yīng)用到一般量子化學(xué)計算中。測試結(jié)果表明,對于上百節(jié)點的計算規(guī)模,該方案比默認的調(diào)度排隊方案提升50%以上的效率(圖1)。結(jié)合該方案,我們在量子化學(xué)層面初步開展了新冠病毒的原始毒株(Wild-type)、奧密克戎變異毒株(Omicron)中重要氨基酸殘基同人類血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2(hACE2)相互作用能的計算,以此來分析新冠病毒的原始毒株、變異毒株結(jié)合人體蛋白時的親和能變化(圖2)。

圖1 基于機器學(xué)習輔助的負載均衡方案
圖2 新冠蛋白重要殘基示意(上),及其同人體蛋白的結(jié)合能力計算(下)
該研究成果已被計算化學(xué)領(lǐng)域的國際期刊Journal of Computational Chemistry(SCI,JCR Q2/中科院 Q3)刊發(fā)。論文第一作者為中心高性能計算部的馬英晉副研究員,合作單位包括深圳灣實驗室、中科院化學(xué)所、溫州大學(xué)、西北大學(xué);論文的通訊作者為馬英晉副研究員、索兵兵教授(西北大學(xué))、金鐘研究員。該研究提出的優(yōu)化方法已同時獲得發(fā)明專利授權(quán)(專利號202010403157.4)。研究工作得到了國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金、中科院青促會專項基金和十四五網(wǎng)信專項的支持。(撰稿:馬英晉)
相關(guān)成果:
1. Yingjin Ma*, Zhiying Li, Xin Chen, Bowen Ding, Teng Lu, Baohua Zhang, Bingbing Suo*, Zhong Jin*,
Machine-Learning assisted Scheduling Optimization and Its Application in Quantum Chemical Calculations,
Journal of Computational Chemistry 2023, 1. https://doi.org/10.1002/jcc.27075
2. 大分子及團簇體系分塊計算負載均衡方法及系統(tǒng),專利號202010403157.4
發(fā)明人:馬英晉,馬碩,張寶花,劉倩,金鐘
申請人:中國科學(xué)院計算機網(wǎng)絡(luò)信息中心
責任編輯:郎楊琴
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